Meritonix oferuje także możliwość realizacji projektów informatycznych związanych z tworzeniem oraz wdrażaniem oprogramowania na potrzeby autorskich projektów klientów. Dotyczy to zarówno dostosowywania lub rozbudowywania funkcjonalności istniejącego oprogramowania jak i tworzenie zupełnie nowych nietypowych systemów realizujących szczególne wymagania. Meritonix jest także otwarty na współpracę jako jeden z podmiotów zajmujących się stroną informatyczną w ramach większych grup zaangażowanych w duże projekty.

Przykładem tego rodzaju oferty jest współpraca w realizacji przedsięwzięcia naukowego wymagającego informatycznego wsparcia.